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人们可能会认为，人文学科的作家们会因为源于科学的新观念百花齐放而高兴和振奋。事实却并非如此。虽然在治愈疾病、监控环境、或者打击政敌时，人们都会对科学点赞，但是，科学对人文领域的涉足却被深深地憎恶，正如运用科学理性来分析宗教问题会遭到谩骂一样。许多根本不信神的作家坚持认为科学家掺乎到这个最大问题的争论中总有那么点不合时宜。在持有这种观点的核心期刊中，会念科学经的外来和尚们经常性地被指责为决定主义、还原主义、本质主义、实证主义，其中最恶劣的是，被称为“科学主义”。过去几年中，单单在这本期刊里就有4次对科学主义的谴责，《书本论坛》、《克莱蒙特图书评论》、《赫芬顿邮报》、《国家》、《国家评论在线》、《新亚特兰蒂斯》、《纽约时报》、和《观点》等媒体也一同发起了攻击。
这些出版物的折衷立场反映出了来自两方面的憎恶。下面这段话来自历史学家杰克逊·里尔斯（Jackson Lears），是他发表在《国家》里一篇对山姆·哈里斯（Sam Harris）的三本书的评论片段，可以作为左派指控的标准案例：
“实证主义假设为社会达尔文主义、流行进化论、科学种族主义和霸权主义观念的发展提供了认识论基础。这些趋势融合于优生学，即一门认为可以通过选择性地培养“健康合格的”人种，清除或消灭“非健康合格的”人种从而使人类素质得到提升并最终完美化的学说......每个学童都知道接下来发生的事情：灾难性的二十世纪。两次世界大战、对无辜者进行规模空前的灭绝性屠杀、难以想象的毁灭性武器的涌现、以及帝国周边的小规模战争——所有这些事件，都不同程度地与科学研究在先进技术中的应用有关。”
来自右派的典型指控，则如乔治·W·布什（George W. Bush）的生物伦理顾问里昂·卡斯（Leon Kass）在2007年的一次演讲中所述：
“关于生物界和人类的科学理论和发现，本身是极受欢迎并且无害的，但它们正被强行用于对抗传统宗教和道德教化，甚至违背我们作为拥有自由和尊严的生物的自我认知。一种准宗教信仰正在我们当中兴起——我称之为“无灵魂的科学主义”——即相信我们的新生物学，能消除所有的神秘，给出对人类生命的完整解释，能纯粹地用科学解释为什么我们有思想、有爱、有创造力、有道德判断、甚至于有信仰......从不犯错。这场争辩的代价高昂：有关我们国家的道德和精神健康，有关科学的持续生命力，以及我们作为人类、作为西方子民的自我认知。”
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