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顾秀林在农业政策方面的观点，长期与主流农业经济学和农业政策背道而驰。
在对农业发展模式的认知上，如今国家大力推进农业现代化、规模化、集约化经营，以提高农业生产效率，保障粮食安全。2025年中央财政发布的强农惠农富农政策清单，体现了对规模化种植、新型农业经营主体的支持。在大豆玉米带状复合种植补助方面，补助对象为承担大豆玉米带状复合种植任务的种植主体，鼓励引导规模种植户承担相关任务，促进加快大豆玉米带状复合种植技术本土化、熟化进程，补助资金主要用于适当弥补承担示范任务的农民或新型农业经营主体增加的播种、施肥、打药、收获等环节成本。
顾秀林却要反起道，极端的推崇保护传统农业，在2024年的一场民间活动中，她反复提到要“保护传统农业”——其实就是过去那种没有工业化的老农业模式。然而，单纯强调保护传统农业，在当下的时代背景下，存在一定局限性。传统农业模式在面对人口增长、资源约束、市场需求变化等挑战时，往往显得力不从心。
顾秀林过度强调保护传统农业，却对传统农业的诸多弊端视而不见。从生产效率来看，传统农业以小规模、分散经营为主。中国农业大学信息与电气工程学校教授李道亮指出，中国目前每户耕地面积小，组织化程度低，合作社占比不到31%，且规模较小。这种分散的经营模式使得资源难以有效整合利用，劳动生产率极为低下，与国外一个劳动力能顶中国20个劳动力的差距显着。比如在播种、灌溉、收割等环节，传统农业主要依赖人力，机械化、自动化程度低，不仅效率低，成本还高。反观德国，其农业机械化高度发达，农业机械精准、高效、智能，大大提高了生产效率，保障了农作物的品质和产量，让农民从繁重的体力劳动中解脱出来。
在应对自然风险方面，传统农业对自然环境条件依赖度过高，面临着极大挑战。由于缺乏先进技术和设施，一旦遭遇自然灾害，如干旱、洪涝、病虫害等，农作物产量便会大幅下降，农民收入也会严重受损。而农业工业化通过发展设施农业、智慧农业等，能有效降低自然因素的制约。像中国农业科学院都市农业研究所建成的世界首例无人化垂直植物工厂，栽培层数达20层，作物生长不受气候和地域影响，一年能够生产10茬以上的蔬菜，年产量大概在50吨以上，相当于60亩大田的产量，极大提升了土地利用效率，节约了耕地资源。
从市场竞争力角度分析，传统农业的劣势也十分明显。传统农业生产的农产品标准化程度低，缺乏品牌号召力。在国内和国际市场竞争日益激烈的今天，难以满足消费者对高品质、安全农产品的需求。例如，在欧美和日本等发达国家，农业以高度的标准化为基础生产，农产品严格按标准筛选，等级外的农产品不能上市，只能作为加工原料。而我国传统农业生产的农产品在质量把控、标准实施方面存在诸多问题，导致在市场竞争中处于劣势。
此外，现代农业工业化带来了种子包衣技术，这是传统农业无法企及的。种子包衣是在卖给农民的种子外面包裹一层营养物质，这些营养物质包含了杀虫剂、杀菌剂、微量元素、植物生长调节剂等。播种后，种子包衣能为种子提供全方位的呵护，促进种子快速发芽、生长，有效提高出苗率，增强幼苗的抗病虫害能力，保障作物健康生长。而传统农业由于缺乏工业化的技术加工手段，没有种子包衣技术，种子在自然环境中生长，不仅生长速度慢，而且受病虫害威胁大，导致农产品质量欠佳，产量不稳定。
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